在正在召开的年美国癌症研究协会（AACR）年会上，首都医科医院病理科车南颖教授采用艾德PCR-9基因产品，探讨胸腔积液细胞学标本在检测融合变异方面的应用，该成果以E-Poster的形式向全球学界展示。
Multi-geneARMSPCRusingbothcfDNAandcfRNAinthesupernatantofpleuraleffusionachievesrapidandaccuracydrivergenemutationsdetection
多基因ARMSPCR实现基于胸腔积液cfDNA和cfRNA的驱动基因突变准确、快速检测
编号#：会场标题：液体活检；循环肿瘤DNA研究背景：晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者的胸腔积液已被证明可用于检测驱动基因突变，特别是当无法获取足够组织时，可作为替代标本。然而，同时检测多个驱动基因变异，特别是融合变异仍然是使用胸腔积液标本的一个挑战。
研究方法：该研究共入组77例有胸腔积液的晚期NSCLC患者，其中49例患者有匹配的肿瘤组织标本。从胸腔积液标本中制备上清液、细胞沉积物和FFPE细胞块，应用艾德PCR-9基因产品进行驱动基因突变检测(图1)。
图1：患者标本收集及分析流程图
研究结果：除了在细胞沉积物和FFPE细胞块DNA以及上清液cfDNA中检测到EGFR、KRAS和HER2突变之外，还在细胞沉积物和FFPE细胞块的RNA中检测到ALK融合，并且在上清液的cfRNA中也成功检测到ALK融合。与匹配的肿瘤组织相比，上清液的总体灵敏度最高，达81.3%。对于SNV/InDels突变检测，上清cfDNA的灵敏度最高，达81.5%；对于ALK融合检测，上清cfRNA的灵敏度为80%，与细胞块相似（83.3%），但优于细胞沉积物（66.7%）（表1）。在未经治疗或在细胞沉积物中观察到恶性细胞的患者中，上清液的检测灵敏度较高，分别为89.5%和92.3%，二者融合检测的灵敏度均为%（表2）。基于以上结果，优先进行胸腔积液cfDNA和cfRNA突变检测，总灵敏度可达85.3%，SNV/InDels突变检测灵敏度为82.1%，融合变异检测灵敏度达%（表3）。
表1：肿瘤组织与胸水上清液、细胞沉淀物或细胞块之间驱动基因突变的一致性
表2：治疗状态和细胞学评价结果对不同类型胸腔积液样本中基因突变检测灵敏度的影响表3：胸腔积液驱动基因突变优化检测流程性能
结论：胸腔积液标本的上清液可以实现基于cfDNA和cfRNA的驱动基因突变检测。一种优化的检测方法可以最大限度地提高胸腔积液样本检测的临床价值，并具有良好的临床常规应用潜力。
专家解读车南颖教授
首都医科大学附属
医院病理科
目前，基于胸腔积液细胞学标本的分子检测在临床指南中已被广泛推荐。以往的研究表明，胸腔积液上清液中含有的ctDNA比血浆中更丰富，并且EGFR驱动突变的检出率更高，尤其是在EGFR-TKI复发患者中，TM的检测更是如此。在我们的研究中，上清液中SNV/InDels的检出率高于细胞学标本（81.5%vs.68.0%或66.7%）。在未检出恶性细胞的胸腔积液上清液中也检测到一定比例的突变。而在胸腔积液中发现恶性细胞的患者样本，无论是细胞块还是细胞沉淀物，其SNV/InDels和融合的检出率均有显著提高。提示胸腔积液细胞学标本的分子检测有必要进行病理学评估。另外，在本研究中我们证实利用基于PCR的方法可以在恶性胸腔积液上清液中提取cfRNA，并成功检测到基因融合，灵敏度高达80%。这进一步证实了胸腔积液标本在检测融合变异方面优于血浆标本。基于胸腔积液cfDNA和cfRNA在基因检测灵敏度和准确性上展现的显著优势，相信随着越来越多的相关研究不断深入，作为更可靠的基因检测标本来源，胸腔积液将会在临床中得到更广泛的认可和应用。预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇转载请注明：http://www.cbpxw.com/hbzz/12310.html
