NGS肿瘤基因检测,助力晚期肺癌患者获益

导读

肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤,占癌症死亡人数的19.4%。预计到年,中国的肺癌患者数量将达到万,成为世界上肺癌人数最多的国家。基因组科学的进步,特别是新一代基因测序技术(NGS)的应用,极大推动了个体化医疗的发展。今天给大家带来一则基于NGS肿瘤基因检测辅助肺癌临床治疗方案选择、耐药性分析和药效评价的真实病例。本病例来自浙江大学医院方勇教授,是一例典型的应用NGS为晚期肺癌患者进行个体化诊疗,显著改善肿瘤病人预后的临床案例。

一患者及病史简介

肖**,男,60岁,因“诊断肺癌1年余伴咳嗽加重2月”入院治疗。1年余前(年10月)体检“肺占位”,行PET-CT检查结果为,“左肺上叶尖后段及下叶背段肿块,伴代谢增高,考虑恶性病变”。“患者既往患严重乙型肝炎肝硬化,拒绝接受手术治疗、化疗及放疗,自行服用中医中药治疗。”

二诊疗过程

年6月,医院就诊,CT检查结果显示“左上肺门处可见团片状高密度影,边界清楚而不光整,可见残端不一毛刺,与邻近胸膜粘连。右中肺、左肺舌段及两下肺少许细条索影。纵隔内见肿大淋巴结影,部分边界欠清,可见强化。两侧胸腔少量积液。颅脑增强MRI检查示肺癌脑转移。”后续诊疗过程如下图所示。

患者治疗过程图示(点击可查看大图)

1第一次穿刺活检(传统方法)及治疗

年6月,对患者左肺肿瘤穿刺组织进行活检,病理检查结果为“腺癌,TTF-1:+,NapsinA:+,ROS1:-”;分子病理检测结果显示“EGFRexon19发生缺失突变,未检测到EGFRexon20TM突变”。根据检测结果,患者开始服用埃克替尼片进行靶向治疗。

第一次分子病理检测结果

2疾病进展

使用埃克替尼进行治疗约天后,患者病情出现进展,检查结果显示“左上肺门肿块稍增大,左上肺动脉起始处稍窄,左上肺不张进展”。

3第二次穿刺活检(传统方法)及治疗

年2月,再次取患者穿刺肿瘤组织进行病理检查和EGFR突变检测,病理检查结果为“低分化癌”,EGFR突变检测结果与第一次组织活检一致,仅发现EGFRexon19缺失突变,遂继续服用埃克替尼片进行治疗。

4病情再次进展

服药约四个月后,患者出现“胸腔积液,左上肺门肿块增大,左侧大量胸腔积液伴左肺大部不张,纵隔右偏。右肺少许炎性纤维灶,胸膜增厚”,病情继续发生进展。

5基于NGS的安诺优达肿瘤基因检测

为寻找可能的耐药原因,全面评估药物疗效和毒副作用,采用患者同期外周血和胸水样本于安诺优达基因科技(北京)有限公司,进行基于NGS的肿瘤个体化诊疗基因检测。外周血ctDNA检测结果为EGFRexon-del,EGFRexon20TM,同时伴有HER2扩增;新鲜胸水样本检测结果为EGFRexon-del,EGFRexon20TM,同时伴有EGFR扩增。

在患者同期血液和胸水样本中均检测到TM这一耐药变异和EGFRexon19del,该结果也证明了安诺优达血液ctDNA检测和组织检测具有较好的一致性。

安诺优达肿瘤基因检测结果

6治疗方案优化带来新转机

对基因测序结果的全面深入解读是安诺优达肿瘤基因检测项目的一大优势,检测结果提示,该患者携带EGFR-TKI的典型耐药位点TM,对第三代EGFR-TKI药物奥希替尼(AZD)敏感。患者于年7月4日购买奥希替尼治疗。服药约30天后“左上肺肿块明显缩小,左侧胸腔积液减少,右侧胸壁小结节缩小”,病情出现好转。

服用奥希替尼治疗效果

三回顾分析

回顾分析此患者整个病程,对于患者服用埃克替尼出现耐药后未检测到其它耐药变异情况,分析原因可能如下:1)当时TM位点尚属于低频变异,超出传统检测方法的灵敏度;2)由于肿瘤的异质性,该穿刺组织未携带TM的相关信息。临床医生在最近一次检测采用NGS进行基因检测,是鉴于患者之前未检测到TM这一耐药变异,可能会有其它的耐药原因,而且根据临床研究,耐药机制复杂,很可能并不是单一变异导致,希望可以通过多基因的平行检测更全面的找寻耐药原因,为患者制定更合适的治疗方案。

总结

通过安诺优达肿瘤基因检测确认了患者的耐药原因是TM,因此患者可以服用奥希替尼进行治疗,且后续疗效较好。肿瘤是复杂的,不断进化的,作为医生,希望在可能的情况下找更多的证据来支持相关的临床决策,为每一位患者负责。方勇教授认为,基于NGS的基因检测,能够指导靶向药物治疗,显著改善肿瘤预后;且通过NGS可能检测到传统基因检测技术无法检测到的低频突变,降低假阴性率,为更多的肺癌患者提供靶向治疗机会。方勇教授基于NGS做了大量的临床研究工作,通过他的临床研究结果显示,ctDNA液体活检同组织活检有很高的一致性(这点在本例患者中也得到体现),可以做为组织活检的补充,其无创、取样方便的特点可以为更多的患者提供检测机会。

安诺优达

总部位于北京,是中国基因组行业的知名企业,国家发改委首批基因检测技术应用示范中心、国家卫计委首批高通量测序临床应用试点单位、国家高新技术企业、北京市发改委“精准医疗与基因工程北京市工程实验室”、中关村高新技术企业,拥有博士后科研工作站。

公司专注于新一代基因组学技术在人类医学健康和生命科学研究两大领域的产业化应用,建立了领先的高通量测序平台和高性能计算平台,并先后和美国illumina公司及阿里云达成战略合作,形成了强大的Bio-IT基础和产业化服务能力。

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